ivanov_p (ivanov_p) wrote,
ivanov_p
ivanov_p

Как-то так это всё было...

Самораспоследняя работа по молекулярной филогении жуков. Исследовали почти 200 семейств, 367 видов. 8 белок-кодрующих генов, постарались сделать все тщательно, поскольку во многих предшествующих исследованиях были досадные ошибки.

Clipboard02

Clipboard03

Clipboard04
Clipboard05

McKenna D., Wild A.L., Kanda K., Bellamy Ch., Beutel R.G., Caterino M.S., Farnum Ch.W., Hawks D.C., Ivie M.A., Jameson M.L., Ledchen R.A.B., Marvaldi A.E., McHugh J.V., Newton A.F., Robertson J.A., Thayer M.K., Whiting M.F., Lawrence J.F., Slipinsky A,. Maddison D.R., Farrell B.D. 2015. The beetle tree of life reveals that Coleoptera survived end-Permian mass extinction to diversify during the Cretaceous terrestrial revolution // Systematic Entomology. 40: 835–880.

Почти все семейства Polyphaga из мела, рост разнообразия был очень быстрым. Основной задачей было изучение отношений высших таксонов, надсемейств и семейств. Большинство групп оказались монофилетичными, с чем все друг друга поздравляют. Веерокрылые сестринские к жукам, в который раз. И даже подотряды жуков монофилетические, что в прошлом иногда не получалось.

Clipboard06

Даны деревья по надсемествам. В целом довольно ожидаемый результат

Clipboard07

Clipboard08

Clipboard09

Clipboard10

Хотя местами просвещенный взгляд дрожит и пугается. Ладно, это только по немногим генам, может быть, потом щетильнее будет.

Clipboard11

Clipboard12

Всюду жизнь. Хотя, конечно, вот прямо так взять и принять это пока трудно

The clade Phytophaga (the sister superfamilies Chrysomeloidea and Curculionoidea) was sister to Cucujoidea s.s. in both the ML and Bayesian trees, with mostly moderate MLB support and maximal BPP support (Figs 2, 15; Figure S2). Phytophaga was monophyletic and received weak to moderate MLB support. Chrysomeloidea and Curculionoidea were each monophyletic. MLB support for Chrysomeloidea was mostly weak. MLB support for Curculionoidea was strong in the analysis of nucleotides alone, and varied from weak to moderate in the other MLB analyses.
...
Superfamily Cucujoidea (in the former broad sense of the superfamily) was polyphyletic, forming three clades (i) the newly recognized grouping Coccinelloidea (Robertson et al., 2015) (Fig. 11), (ii) Biphyllidae (Diplocoelus Guérin-Ménéville) and Byturidae (Dascillocyphon Everts and Xerasia Lewis) within Cleroidea (Fig. 13), and (iii) the remaining Cucujoidea s.s. (see above section Series and Superfamily-level Relationships within Polyphaga; Fig. 12). Within Coccinelloidea (Fig. 11), two major clades were recovered: (i) a strongly supported clade with Latridiidae (Corticaria Marsham and Eufallia Muttkowski), Cerylonidae (four exemplars, not monophyletic), Bothrideridae (three exemplars, not monophyletic), and Discolomatidae (Aphanocephalus Wollaston and Fallia Sharp), and (ii) a weakly supported clade comprising the rest of the Cerylonid Series. Bothrideridae and Cerylonidae were intermingled, and these together were rendered paraphyletic by Discolomatidae in both the BI and ML trees (Fig. 11). The two exemplars of Latridiidae, representing the two described subfamilies, were recovered together with strong nodal support. Endomychidae (four exemplars) was polyphyletic.

...
Nearly all of the backbone relationships in Cucujoidea s.s. had negligible MLB support (Fig. 12). Erotylidae (five exemplars) was monophyletic in the ML and BI trees and had moderate to strong MLB support and maximal BPP support. Sphindidae (Protosphindus Sen Gupta & Crowson and Sphindus Chevrolat) was rendered paraphyletic by Protocucujidae under ML and by Helotidae and Protocucujidae under BI. Nodal support for these relationships was moderate, at best. Phalacridae (Olibrus Erichson and Phalacrinus Blackburn) was sister to a clade containing Laemophloeus Dejean (Laemophloeidae)+Propalticus Sharp Propalticidae). Monotomidae (Bactridium and Rhizophagus) was sister to the clade Kateretidae (Amartus)+Nitidulidae (four exemplars) in the ML tree. In the BI tree, Kateretidae rendered Nitidulidae paraphyletic. Cryptophagidae (four exemplars) and Silvanidae (Uleiota Latreille, Oryzaephilus Ganglbauer) were polyphyletic.
Cleroidea plus the cucujoid families Biphyllidae and Byturidae was monophyletic in theML and BI trees (see above section Series and Superfamily-level Relationships within Polyphaga; Figs 2, 13; Figure S2).

Иногда авторы удивляются: это как же так, что за такая штука...
The polyphyly of both Cryptophagidae (four exemplars) and Silvanidae (two exemplars) was unexpected and is inconsistent with previous analyses of morphological (e.g. Lawrence et al., 2011) and molecular data (e.g. McElrath et al., 2015), which suggest these families, at least to the extent sampled, are monophyletic.

Чтобы показать, как это было быстро, придумали такой рисунок
Clipboard13

В таблице показали, у кого скорость эволюции росла, у кого падала
Clipboard14
Subscribe

  • Богословие Нильса Бора

    Книга о средневековом византийском богословии, учебник. Потрясающая ясность изложения самых неясных вопросов. Рекомендовал бы читать и тем, кто…

  • Вся история

    Учебник по истории России от неолита до наших дней, Кагарлицкий-Сергеев, 2018 по цитированным кусочкам можно видеть, что с чем сопоставляют, что как…

  • Датировки

    Вагнер. Научные методы датирования 2006, первое англ. издание 1996 г.

  • Post a new comment

    Error

    Anonymous comments are disabled in this journal

    default userpic
  • 0 comments